Kategória špeciálne nátery zahŕňa menej používané typy náterových systémov, ktoré nachádzajú uplatnenie najmä v netypických alebo špecifických podmienkach. Do tejto skupiny patria polyesterové, vinylesterové, kopolymérové a keramické nátery. Sú to riešenia, ktoré sa volia vtedy, keď konvenčné systémy nie sú vhodné z hľadiska materiálu, prostredia alebo požadovaných vlastností. Každý z nich má svoje špecifické využitie a dôvody, prečo je zaradený medzi „špeciálne“.

• Polyesterové nátery sú druh náterov s vysokou koróznou odolnosťou až do 30 rokov. Obsahujú sklenené vločky, čo im poskytuje vysokú oderuvzdornosť a stabilitu. Aplikujú sa vo veľkých hrúbkach na abrazívne čistenú oceľ. Ich využitie je hlavne v námornom a off shore priemysle pre dosiahnutie dlhodobej ochrany. 
• Vinylesterové nátery sú riešením pre extrémne chemicky namáhané prostredia. Vďaka vysokej chemickej, tepelnej a mechanickej odolnosti sa používajú najmä zvnútra priemyselných nádrží, vaní alebo iných konštrukcií, ktoré prichádzajú do styku s agresívnymi médiami, vrátane kyselín do 150 °C. Ide o robustné, viackomponentné systémy s možnosťou vystuženia sklenenými vločkami 
• Kopolymérové nátery sú univerzálne ochranné povlaky založené na zmesi rôznych polymérov, ktoré vďaka tomu kombinujú vlastnosti ako pružnosť, odolnosť voči UV žiareniu a nárazom.
  
• Keramické nátery sú určené do extrémne namáhaných podmienok, najmä vysokých teplôt, abrazívneho opotrebenia a chemickej korózie. Bežne sa používajú v automobilovom, strojárskom alebo petrochemickom priemysle, kde chránia kovové povrchy. Vďaka ich tvrdosti, nízkej tepelnej vodivosti a výbornej odolnosti voči opotrebovaniu sa uplatňujú napríklad na ložiská, výmenníky tepla alebo časti plynových turbín.